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Le développement récent de la technologie du cDNA ARRAY autorise l'analyse simultanée de l'expression génique (transcriptome) à large échelle. Ceci permet l'identification de nouveaux gènes pouvant participer à la cancérogénèse, la croissance et la progression tumorale ou pouvant constituer de nouvelles cibles diagnostiques ou thérapeutiques

Le profil d'expression génique des cellules cancéreuses pancréatiques humaines (Capan-1, Capan-2, Bx-PC-3, MiaPaca-2) a été comparé à celui du pancréas normal humain (n = 3) et de deux lignées cancéreuses humaines non pancréatiques (HT-29 : adénocarcinome colique, K562 = leucémie myéloïde chronique). L'ARN total (20 à 40 μg) était extrait par Rneasy (Quiagen), la transcription inverse était réalisée en présence de P33. L'hybridation était faite sur membranes Atlas Human Cancer 1.2 (Clonetch — 1 176 gènes), la lecture était faite par phosphorimageur et analysée de façon informatisée par AtlasImage 1.5 Clontech Program (deux hybridations séparées par lignée ou tissu).

Plusieurs familles de gènes ont été isolées. Ces gènes étaient fortement exprimés de façon spécifique et cohérente dans toutes les cellules cancéreuses pancréatiques (rapport minimal de + 2,5 – maximum + 16). Il s'agissait de 75 gènes au total (6,3 %) impliqués dans la régulation du cycle cellulaire, la prolifération cellulaire ou codant pour des facteurs de croissance, pour des protéines du cytosquelette, pour des protéines de la matrice extracellulaire, des molécules d'adhésion, des oncogènes, des protéines impliquées dans les processus apoptotiques et métaboliques. Trente—quatre de ces gènes (45,3 %) n'avaient jusqu'alors pas été isolés comme surexprimés dans les cellules cancéreuse pancréatiques humaines : le niveau d'expression était notamment très élevé pour intégrines &agr;3 et &bgr;8, paxillin, kératine 14, TIMP3, PRSM1, GST.

L'analyse par MACRO ARRAY a permis d'isoler de nouveaux gènes spécifiquement surexprimés dans les cellules cancéreuses pancréatiques humaines. Leur expression quantitative exacte au sein des cellules et des pièces d'adénocarcinome doit être mesurée. Ces gènes codant pour des protéines impliquées dans de nombreux processus cellulaires tels que transformation, prolifération, migration ou apoptose, pourront constituer de nouveaux marqueurs ou cibles du cancer pancréatique humain.