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Notre but a été de développer une méthode rapide et fiable pour détecter la résistance à la clarithromycine directement sur les biopsies gastriques.

Un test PCR en temps réel a été développé, suivi d'une analyse des courbes de fusion des amplicons, en utilisant le LightCycler®.

La méthode a été appliquée avec succès sur des souches de référence et des biopsies négatives. Les biopsies de 200 patients pour lesquels un premier traitement d'éradication avait échoué, et pour qui la souche de H. pylori était disponible, ont ensuite été testées avec cette nouvelle technique. Un génotype unique était présent dans 157 cas, 2 génotypes dans 41 cas et 3 génotypes dans un cas. Il y a eu au total, 7 discordances avec la méthode phénotypique. La PCR-RFLP a été appliquée dans tous les cas discordants. Dans 4 cas, la nouvelle méthode détectait la population résistante à une concentration si faible qu'elle restait non détectée par les méthodes phénotypiques, et dans 3 cas, la résistance pourrait être due à d'autres mutations.

Cette méthode a une fiabilité au moins aussi satisfaisante que les tests phénotypiques et peut être réalisée en 2 heures, permettant ainsi son utilisation avant d'administrer un premier traitement d'éradication.