Résumé selectionné

	mardi 6 avril 2004
	Poster

Hybridation soustractive appliquée à l'étude des souches de Helicobacter pylori associées au lymphome gastrique du MALT

P Lehours⁽³⁾ , S Dupouy⁽³⁾ , B Bergey⁽³⁾ , F Richy⁽³⁾ , F Zerbib⁽³⁾ , A Ruskone Fourmestraux⁽¹⁾ , J Tankovic⁽²⁾ , JC Delchier⁽²⁾ , F Mégraud⁽³⁾ , A Ménard⁽³⁾

⁽¹⁾ Service de Gastroentérologie, Hôtel Dieu, AP-HP, Paris
⁽²⁾ Service de Gastroentérologie, Hôpital Henri Mondor, Créteil
⁽³⁾ Laboratoire de Bactériologie Pr F Mégraud, Université Victor Segalen, Bordeaux

Mots clés :
10 Helicobacter Pylori : Fondamental, Epidémiologie
60 Biologie Moléculaire, Génétique
72 Lymphome

Introduction

Helicobacter pylori est associé au lymphome gastrique du MALT mais aucun facteur de virulence connu à ce jour n'a pu être associé au développement de ce cancer.

Matériels et Méthodes

Nous avons utilisé la technique d'hybridation soustractive afin d'identifier des gènes de H. pylori associés au lymphome gastrique qui pourraient correspondre, soit à de simples marqueurs de ces souches, soit à de nouveaux facteurs de virulence. Deux souches cagA positive ont ainsi été comparées : une souche d'intérêt isolée d'un patient de 29 ans atteints d'un lymphome gastrique du MALT de bas grade et une souche témoin isolée d'un patient de 74 ans qui ne présentait au diagnostic qu'une simple gastrite.

Résultats

Parmi les 82 séquences non redondantes de la banque obtenue, 39 étaient spécifiques à la souche de MALT dont 26 (66,7 %) homologues à des gènes des deux souches de référence publiées pour H. pylori (J99 et 26695), 9 (23,1 %) à des gènes spécifiques de la souche J99 et 4 (10,2 %) ne présentaient aucune homologie dans les banques de données. La localisation de ces séquences dans le génome bactérien a été effectuée par une technique mise au point au laboratoire de marche sur le chromosome. L'analyse par dot blot de la répartition de ces séquences dans une collection de 43 souches de H. pylori associées au lymphome du MALT de bas grade et 39 souches de gastrites appariées sur l'âge a permis d'identifier deux ORF associées aux souches de lymphome, l'ORF JHP950 (74 % versus 49 % ; p = 0,017) localisé dans la zone de plasticité du génome de H. pylori et l'ORF JHP1462 (26 % versus 2,5% ; p = 0,003). Ces deux ORF codent pour des protéines putatives sans fonction connue. Une analyse en composante multiple n'a pas permis d'identifier de groupe de gènes caractéristique du lymphome ou de la gastrite.

Discussion

Nous décrivons ici les premiers marqueurs potentiels de souches de H. pylori associés au lymphome gastrique du MALT. L'ORF JHP 1462 serait un marqueur de faible sensibilité bien que très spécifique. L'ORF JHP950 serait associé au lymphome gastrique du MALT de manière au moins aussi forte que le gène cagA l'est avec les souches d'ulcère.

Conclusion

Nous vérifions actuellement la validité de ces marqueurs en les testant en particulier dans une collection de souches de H. pylori associés à l'ulcère et à l'adénocarcinome. L'analyse des gènes présents dans les quatre régions originales que nous avons identifiées nous apporte également une approche nouvelle de la diversité génétique de H. pylori. Par ailleurs, ces gènes pourraient correspondre à de nouveaux facteurs de virulence.