Résumé selectionné

	mardi 6 avril 2004
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Intérêt de la PCR en temps réel sur biopsies gastriques pour la détection quantitative rapide de Helicobacter pylori couplée à la détermination de la sensibilité à la clarithromycine

J Tankovic⁽³⁾ , C Lascols⁽⁴⁾ , D Lamarque⁽⁵⁾ , JM Costa⁽¹⁾ , C Copie-Bergmann⁽²⁾ , JC Petit⁽³⁾ , CJ Soussy⁽⁴⁾ , JC Delchier⁽⁵⁾

⁽¹⁾ Laboratoire de Biologie Moléculaire, Hôpital Américain de Paris, Neuilly
⁽²⁾ Département de Pathologie, Hôpital Henri-Mondor, Créteil
⁽³⁾ Service de Bactériologie, Hôpital Saint Antoine, Paris
⁽⁴⁾ Service de Bactériologie, Hôpital Henri-Mondor, Créteil
⁽⁵⁾ Service d'Hépato Gastroentérologie, Hôpital Henri-Mondor, Créteil

Mots clés :
11 Helicobacter Pylori : Diagnostic, Traitement, Complications
10 Helicobacter Pylori : Fondamental, Epidémiologie

Introduction

L'identification rapide des patients infectés par des souches de H. pylori résistantes à la clarithromycine sans passer par la culture peut permettre d'éviter des prescriptions inutiles de clarithromycine. De plus, une telle technique serait très utile pour conduire des études nationales ou internationales sur la prévalence de l'infection et de la résistance à cet antibiotique.

Matériels et Méthodes

Nous avons développé et testé un test de routine basé sur la PCR quantitative en temps réel avec l'appareil Light Cycler (Roche). Cent quatre-vingt-seize biopsies gastriques consécutives ont été examinées par culture, histologie pratiquée par un praticien entraîné, et par PCR. L'infection était définie par (i) la positivité de la culture, (ii) la positivité de l'histologie, ou (iii) la positivité de la PCR mais seulement si celle-ci était confirmée par un test indirect concomitant : sérologie ou test respiratoire. La sensibilité à la clarithromycine a été évaluée par E-test et PCR.

Résultats

La prévalence de l'infection était de 34 % (66/196). La sensibilité de la culture était de 91 % (60/66), celle de l'histologie de 88 % (58/66) et celle de la PCR de 97 % (64/66). La spécificité de la PCR était de 95 % (123/130). La PCR a permis une quantification fiable de la charge bactérienne jusqu'à un minimum d'environ 300 bactéries par extrait d'ADN et une détection minimale d'environ 30 bactéries par extrait. La charge bactérienne était corrélée à l'activité de la gastrite au niveau antral et fundique. La concordance entre le E-test et la PCR pour la sensibilité à la clarithromycine était de 98 % (55/56) avec une prévalence de la résistance de 16 %. La seule discordance concernait une culture qui était en fait un mélange d'une souche sensible, largement majoritaire (91 % de la population bactérienne) et d'un mutant résistant. Le mutant résistant a été détecté par E-test mais pas par PCR.

Conclusion

Notre technique PCR a montré sa fiabilité en routine pour la détection rapide de H. pylori et de sa résistance éventuelle à la clarithromycine, avec possibilité de quantification précise de la charge bactérienne.