Résumé selectionné |
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Caractérisation d'un profil particulier de méthylation du gène Igf2 dans les lymphocytes circulants en cas de polypose adénomateuse familiale, de cancer colorectal héréditaire sans polypose et de cancer colorectal sporadique
A Miroglio (1); H Jammes (1); I Gut (2); J Tost (2); S Grandjouan (1); S Chaussade (1); L Dandolo (1); D Lamarque (1); (1) Paris - FRANCE (2) Évry - FRANCE Mots clés : 60 Biologie Moléculaire, Génétique 88 Noyau, Expression Des Gènes, Transfert Des Gènes 62 Dépistage, Prévention, Diagnostic | |||||||||||||||
IntroductionIgf2 est un facteur de croissance dont l’expression est augmentée dans le cancer colorectal (CCR). L’augmentation de cette expression est également trouvée dans les lymphocytes circulants des patients atteints de CCR et chez les apparentés ce qui en fait un facteur de prédisposition (Gastroenterology 2004 ; 126 : 964–970). L’augmentation de l’expression d’Igf2 est la conséquence de la déméthylation des nucléotides de l’allèle maternel du gène. La déméthylation d’Igf2 pourrait être une modification épigénétique, non spécifique de l’organe et constituer un marqueur associé aux mutations génétiques germinales, polypose adénomateuse familiale (PAF) et cancer colorectal héréditaire sans polypose (HNPCC). Cette étude a pour but d’étudier le statut de méthylation d’Igf2 à partir d’ADN extraits de lymphocytes chez des patients ayant une PAF, une HNPCC par rapport à des patients atteints de CCR sporadique ou à des témoins. Matériels et MéthodesLes ADN lymphocytaires étaient issus de 19 témoins et de patients atteints de PAF dans 26 cas, de HNPCC dans 16 cas, de CRC sporadiques dans 5 cas. L’analyse de la méthylation gène Igf2 a été effectuée par pyroséquencage, nouvelle technique qui permet de quantifier précisément le pourcentage de méthylation de chaque îlot de dinucléotides (CpG) d’une région différentiellement méthylée (DMR). Nous avons analysé la méthylation des DMR0 et DMR2 qui contiennent 3 et 17 CpG respectivement. RésultatsLes pourcentages de méthylation de tous les CpG confondus sont présentés dans le tableau suivant :
L’analyse détaillée du profil de méthylation des CpG montrait chez les patients atteints de PAF ou de HNPCC, une hypométhylation significative de la DMR2 d’IGF2 (5 CpG sur 17 et 3 CpG sur 17, respectivement) en comparaison avec l’ADN de patients témoins ou ayant un CCR sporadique (P<0,001). Chez les patients ayant un CCR sporadique, il existait une hypométhylation de la DMR0 (1 CpG sur 3) et de la DMR2 (1 CpG sur 17) (P<0,001). Conclusionla PAF s’accompagne d’une hypométhylation significative dela DMR2 d’Igf2 dans les lymphocytes circulants par rapport àdes patients ayant un CCR sporadique ou des témoins. Les patients atteints de CCR sporadique ont une hypométhylation de la DMR0 d’Igf2 par rapport aux témoins. L’analyse du profil de méthylation d’Igf2 par pyroséquencage à partir du sang circulant pourrait permettre le dépistage des différentes prédispositions génétiques au CCR. Travail réalisé avec l’aide de l’IRMAD (dotation 2002 et 2003) et du fond de recherche de la SNFGE (dotation 2004). |
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