Introduction

La microflore bactérienne intestinale (notamment la microflore associée à la muqueuse) semble jouer un rôle important dans l'initiation et/ou le maintien de la maladie de Crohn. Les lésions de la maladie de Crohn sont fréquemment discontinues. L'objectif de ce travail a été d'analyser et de comparer la microflore dominante associée à la muqueuse iléale dans des zones malades et des zones saines.
 

 Matériels et Méthodes

Pour chaque patient (n = 22), des échantillons de tissus (pièce opératoire de 4 cm² de muqueuse et biopsies) provenant de zones macroscopiquement lésées et saines adjacentes ont été prélevés au cours de résections iléo-caecales pour maladie de Crohn. L'analyse de la microflore associée à la muqueuse iléale a été réalisée par 2 méthodes moléculaires différentes et complémentaires : hybridation in situ avec des sondes oligonucléotidiques fluorescentes ciblant l'ARNr 16S des principaux groupes bactériens et électrophorèse en gradient de dénaturation thermique au cours du temps.
 

 Résultats

Les bactéries étaient essentiellement présentes dans la couche de mucus. Aucune bactérie intracellulaire n'a été observée. Des échantillons provenant à la fois de muqueuse saine et lésée ont été obtenus pour 15 patients. La distribution des différents niveaux de populations bactériennes au sein de la microflore associée à la muqueuse n'était pas significativement différente entre zones saines et zones lésées. Le phylum Bacteroidetes était dominant et représentait 29% (0 à 74%) de la microflore associée à la muqueuse saine et 32 % (0 à 70%) de la microflore associée à la muqueuse lésée. Les γprotéobactéries représentaient 12% (0 à 70%) de la microflore associée à la muqueuse saine et lésée. Le groupe Clostridium coccoides (Phylum Firmicutes) représentait 15% de la flore associée à la muqueuse saine et 7% au niveau de la muqueuse lésée. Le groupe Lactobacillus/Enterococcus, le genre Bifidobacterium et le sous groupe Faecalibacterium prausnitzii étaient retrouvés à de faibles pourcentages. La composition des différents groupes bactériens de la microflore associée à la muqueuse n'était pas significativement différente entre muqueuse saine et muqueuse lésée. Pour 8 sur 10 patients, le coefficient de similarité entre les différents profils appariés de l'électrophorèse en gradient de dénaturation thermique au cours du temps était très élevé (90.4% ± 8.7%). Les résultats étaient cohérents par les 2 méthodes moléculaires.
 

 Conclusion

Dans la maladie de Crohn, la microflore dominante présente au niveau de la muqueuse iléale lésée ne diffère pas de celle présente au niveau de la muqueuse iléale saine. Ceci n'exclut pas un rôle de bactéries sous-dominantes mais démontre que des modifications de la flore dominante ne sont pas une explication au caractère focal des lésions.