Introduction

On a récemment découvert que le génome humain présentait de nombreuses anomalies, nommées Copy Number Variants (CNVs), qui consistent en des insertions, duplications, délétions ou inversions de longs segments d'ADN. Un CNV est défini comme un segment d'ADN dont le nombre de copies est différent de celui trouvé dans le génome de référence. Ces anomalies seraient accompagnées d'une perte ou d'un gain de fonction et pourraient donc être responsables d'un phénotype prédisposant à une certaine pathologie. Nous avons émis l'hypothèse selon laquelle le cancer pancréatique sporadique serait « une maladie génétique complexe » dans laquelle le gain ou la perte de fonctions associées aux CNVs pourrait être un facteur prédisposant.
 

 Matériels et Méthodes

L'ADN génomique de 31 patients (24 Européens et 7 Japonais) atteints d'un adénocarcinome pancréatique a été extrait des leucocytes périphériques puis analysé en utilisant un GeneChip Human Mapping 500K Array Set (Affymetrix). Plus de 500000 sondes couvrant la totalité du génome ont été analysées. Les valeurs obtenues pour chaque patient ont été comparées à celles des 270 individus apparemment indemnes, considérées comme valeurs de référence.
 

 Résultats

Nous avons identifié environ 30000 CNV sur le génome de chaque patient, ce qui est en accord avec la littérature. Certains d'entre eux sont communs à tous les patients et absents de la population contrôle. Leur nombre diminue avec le nombre de patients inclus mais se stabilise à partir de 17 patients. Nous avons identifié 166 anomalies communes à tous les patients dont 84 correspondaient à des amplifications (3 ou 4 copies) et 72 à de délétions (1 ou 0 copies). De nombreux gènes impliqués dans le processus de carcinogènese pancréatique en font partie (KRAS, NOTCH3, AKT3 entre autres). La comparaison des données provenant des patients Japonais et des Européens a révélé une importante divergence entre les CNVs identifiés, ainsi que la différence ethnique le laissait prévoir, sauf pour les gènes associés au cancer du pancréas qui sont conservés.
 

 Discussion

 Conclusion

Ce travail a permis d'identifier un certain nombre d'anomalies génomiques germinales présentes chez les patients atteints d'une forme sporadique de cancer du pancréas. Ces gènes pourraient représenter une signature permettant l'identification précoce des individus porteurs d'une prédisposition au développement de la maladie et sont également de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles du cancer pancréatique.