Les fondamentaux de la pathologie digestive

par la CDU-HGE - Editions Elsevier-Masson
Paru le 22 octobre 2014

L’ambition de cet ouvrage est de donner aux étudiants et aux médecins déjà en exercice les clefs de compréhension du fonctionnement normal et anormal de l’appareil digestif, en complément indispensable de l’ouvrage collégial de référence de la pathologie digestive médico-chirurgicale.

La création de ces « fondamentaux » s’est faite à l’initiative de la Collégiale des universitaires en hépato-gastro-entérologie (CDU-HGE), en collaboration précieuse et efficace avec les enseignants et collèges de chirurgie digestive, chirurgie générale, radiologie, physiologie, anatomo-pathologie et pharmacologie.

La constitution et le fonctionnement des différents organes de l’appareil digestif sont détaillés successivement, avant de faire place à treize chapitres de synthèse, abordant des thèmes aussi variés que la digestion, l’oncogénétique digestive, le microbiote intestinal ou l’endoscopie digestive. Cette double entrée de lecture permet de passer directement de l’acquisition à la mise en perspective synthétique - et donc à la consolidation - des connaissances.

Toute reproduction, traduction, mise en ligne de l’ouvrage est interdite sans l’accord préalable de l’éditeur et des auteurs.

Les auteurs

Ce livre a été rédigé sous l’égide de la CDU-HGE, la Collégiale des universitaires en hépato-gastro-entérologie.

Coordonnateurs

Laurent Beaugerie
Hépato-gastro-entérologue, université Pierre et Marie Curie Paris 6 et AP-HP, hôpital Saint-Antoine, Paris

Harry Sokol
Hépato-gastro-entérologue, université Pierre et Marie Curie Paris 6 et AP-HP, hôpital Saint-Antoine, Paris

Comité de rédaction

Christophe Aubé
Radiologue, université d’Angers et CHU, Angers

Marc Bardou
hépato-gastro-entérologue et pharmacologue clinicien, université de Dijon et CHU, Dijon

Laurent Beaugerie
Hépato-gastro-entérologue, université Pierre et Marie Curie Paris 6 et AP-HP, hôpital Saint-Antoine, Paris

Guillaume Cadiot
Hépato-gastro-entérologue, université de Reims et CHU, Reims

Jean-Charles Delchier
Hépato-gastro-entérologue, université Paris 12 et hôpital Henri Mondor, Créteil

Xavier Dray
Hépato-gastro-entérologue, université Paris Diderot 7 et AP-HP, hôpital Lariboisière, Paris

Philippe Ducrotté
Hépato-gastro-entérologue, université de Rouen et hôpital Charles Nicolle, Rouen

François Durand
Hépato-gastro-entérologue, université Paris Diderot 7 et AP-HP, hôpital Beaujon, Clichy-la-Garenne

Jean-Luc Faucheron
Chirurgien général, université Joseph Fourier et CHU de Grenoble, Grenoble

Mehdi Karoui
Chirurgien digestif, université Pierre et Marie Curie Paris 6 et AP-HP, hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Paris

Philippe Lévy
Hépato-gastro-entérologue, université Paris Diderot 7 et AP-HP, hôpital Beaujon, Paris

Alexandre Louvet
Hépato-gastro-entérologue, université de Lille 2 et hôpital Claude Huriez, Lille

Olivier Lucidarme
Radiologue, université Pierre et Marie Curie Paris 6 et AP-HP, hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Paris

Vincent Mallet
Hépato-gastro-entérologue, université Paris Descartes et AP-HP, CHU Cochin-Port Royal, Paris

François Mion
Hépato-gastro-entérologue et physiologiste, université Claude Bernard Lyon 1 et hôpital Édouard Herriot, Hospices civils de Lyon, Lyon

Guillaume Portier
Chirurgien digestif, université Toulouse III et CHU Toulouse Purpan, Toulouse

Jean-Christophe Saurin
Hépato-gastro-entérologue, université Claude Bernard Lyon 1 et hôpital Édouard Herriot, Hospices civils de Lyon, Lyon

Laurent Siproudhis
Hépato-gastro-entérologue, université de Rennes et hôpital Pontchaillou, Rennes

Harry Sokol
Hépato-gastro-entérologue, université Pierre et Marie Curie Paris 6 et AP-HP, hôpital Saint-Antoine, Paris

Philippe Soyer
Radiologue, université Paris Diderot 7 et AP-HP, hôpital Lariboisière, Paris

Jean-Christophe Vaillant
Chirurgien général, université Pierre et Marie Curie Paris 6 et AP-HP, hôpital de la Pitié-Salpêtrière, Paris

Dominique Wendum
Anatomo-pathologiste, université Pierre et Marie Curie Paris 6 et AP-HP, hôpital Saint-Antoine, Paris

Autres rédacteurs

Françoise Goirand
Pharmacienne et pharmacologue, université de Dijon et CHU, Dijon

Sabine Roman
Hépato-gastro-entérologue et physiologiste, université Claude Bernard Lyon 1 et hôpital Édouard Herriot, Hospices civils de Lyon, Lyon

Relecteurs

Marc Barthet
Hépato-gastro-entérologue, université de la Méditerranée et CHU, Marseille

Robert Benamouzig
Hépato-gastro-entérologue, université de Paris 13 et AP-HP, hôpital Avicenne, Bobigny (relecture générale)

Louis Buscail
Hépato-gastro-entérologue, université Paul Sabatier Toulouse 3 et CHU Toulouse-Rangueil, Toulouse

Maïté Lewin
Radiologue, université Paris-Sud et AP-HP, Hôpital Paul Brousse, Villejuif

Philippe Marteau
Hépato-gastro-entérologue, université Paris Diderot 7 et AP-HP, hôpital Lariboisière, Paris

Dominique Valla
Hépato-gastro-entérologue, université Paris Diderot 7 et AP-HP, hôpital Beaujon, Clichy-la Garenne

Frank Zerbib
Hépato-gastro-entérologue, université de Bordeaux et hôpital Saint-André, CHU de Bordeaux, Bordeaux

Fabien Zoulim
Hépato-gastro-entérologue, université Claude Bernard Lyon 1 et Hospices civils de Lyon, Lyon

Avant-propos

Les longues études de médecine comportent un risque : celui d’empiler simplement les connaissances, des plus fondamentales aux plus cliniques, sans intégration du savoir. Pourtant, le raisonnement clinique du praticien face au patient est d’autant plus efficace qu’il s’adosse à une connaissance intégrée et durable de points essentiels d’anatomie, d’histologie et de physiopathologie, en plus d’une maîtrise parfaite de la sémiologie.

L’ambition de cet ouvrage est de donner aux étudiants et aux médecins déjà en exercice les clefs de compréhension du fonctionnement normal et anormal de l’appareil digestif, en complément indispensable de l’ouvrage collégial de référence de la pathologie digestive médico-chirurgicale.

La création de ces « fondamentaux » s’est faite à l’initiative de la Collégiale des universitaires en hépato-gastro-entérologie, en collaboration précieuse et efficace avec les enseignants et collèges de chirurgie digestive, chirurgie générale, radiologie, physiologie, anatomo-pathologie et pharmacologie. La constitution et le fonctionnement des différents organes de l’appareil digestif sont détaillés successivement, avant de faire place à treize chapitres de synthèse, abordant des thèmes aussi variés que la digestion, l’oncogénétique digestive, le microbiote intestinal ou l’endoscopie digestive. Cette double entrée de lecture permet de passer directement de l’acquisition à la mise en perspective synthétique – et donc à la consolidation – des connaissances.

Les utilisateurs visés principalement ici sont les étudiants de deuxième ou troisième année du programme du diplôme de la Formation générale en sciences médicales, qui abordent dans beaucoup d’universités maintenant de façon intégrée l’enseignement de la pathologie digestive.

Nous avons aussi souhaité offrir à tous les praticiens la possibilité de revenir à tout moment aux fondamentaux actualisés de la pathologie digestive, au gré de leur besoin clinique, de médecine générale comme de spécialité.

Professeur Laurent Beaugerie
Docteur Harry Sokol

Coordonnateurs de l'ouvrage

Abréviations

AGCC

acides gras à chaîne courte

AIN

anal intraepithelial neoplasia

ALAT

alanine aminotransférase

ASAT

aspartate aminotransférase

ASBT

apical sodium-dependent bile acid transporter

BER

base excision repair

BP

binding protein

CCK

cholécystokinine

CCS

copper chaperone for superoxide dismutase

CFTR

cystic fibrosis transmembrane conductance regulator

CLR

C-type lectin-like receptors

CMM

complexe moteur migrant

CPA

cellules présentatrices de l’antigène

CPGA

contractions propagées de grande amplitude

CPRE

cholangiopancréatographie rétrograde endoscopique

CTZ

chemoreceptive trigger zone

DAG

dyacylglycérol

ECL

enterochromaffin-like

EHEC

Escherichia coli entérohémorragiques

ETEC

Escherichia coli entérotoxinogène

FODMAPs

fermentable oligosaccharides, disaccharides, monosaccharides and polyols

GGT

gamma-glutamyltransférase

HAPC

high amplitude propagated contractions

HEV

high endothelial venules

HPV

human papillomavirus

IEL

intraepithelial lymphocytes

IFN

interféron

IPEX

immunodysregulation, polyendocrinopathy, enteropathy, X-linked syndrome

IPP

inhibiteurs de la pompe à protons

IRM

imagerie par résonance magnétique

LPS

lipopolysaccharide

LT

toxine thermolabile

N-CAM

neural cell adhesion molecule

NADPH

nicotinamide adénine dinucléotide phosphate

NLR

NOD-like receptors

NOTES

natural orifice transendoscopic surgery

NSE

neuron specific enolase

OA

anions organiques

OMS

Organisation mondiale de la santé

PAMP

pathogen associated molecular pattern

PCR

polymerase chain reaction

PK

protéine kinase

PKC

protéine kinase C

POIC

pseudo-obstruction intestinale chronique

PP

polypeptide pancréatique

PP

protéine phosphatase

PRR

pattern recognition receptor

RLR

RIG-I-like receptors

SHU

syndrome hémolytique et urémique

SIO

sphincter inférieur de l’œsophage

SSO

sphincter supérieur de l’œsophage

TCA

temps de céphaline activée

TDM

tomodensitométrie

TFPI

tissue factor pathway inhibitor

TGF

transforming growth factor

TGO

transaminase glutamate-oxaloacétate

TGP

transaminase glutamate-pyruvate

TIPS

transjugular intrahepatic portosystemic shunt

TLR

Toll-like receptors

TOGD

transit œsogastroduodénal

VHC

virus de l’hépatite C

VIH

virus de l’immunodéficience humaine

VIP

vasoactive intestinal peptide

 

Chapitre 1 : Œsophage

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  1. Embryologie
  2. Anatomie
  3. Radioanatomie
  4. Histologie
  5. Physiologie œsophagienne
  6. Sémiologie œsophagienne
  7. Reflux gastro-œsophagien
  8. Examen clinique d’un patient consultant pour dysphagie
  9. Techniques d’exploration de l’œsophage
  10. Bases du traitement médical du reflux gastro-œsophagien
Chapitre 2 : Estomac-Duodénum

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  1. Embryologie
  2. Anatomie de l'estomac
  3. Anatomie du duodénum
  4. Radioanatomie
  5. Histologie
  6. Physiologie
  7. Sémiologie
  8. Examen clinique d’un patient consultant pour nausées et vomissements
  9. Examen clinique d’un patient consultant pour douleur épigastrique
  10. Techniques d’exploration de l'estomac et du duodénum
  11. Helicobacter pylori
  12. Bases du traitement
Chapitre 3 : Jéjunum-Iléon

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  1. Embryologie
  2. Anatomie
  3. Radioanatomie
  4. Histologie
  5. Physiologie intestinale
  6. Sémiologie
  7. Interrogatoire d'une diarrhée
  8. Techniques d’exploration de l'intestin grêle
  9. Bases du traitement symptomatique d'une diarrhée
Chapitre 4 : Côlon

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  1. Embryologie
  2. Anatomie
  3. Radioanatomie
  4. Histologie
  5. Physiologie colique
  6. Sémiologie
  7. Examen clinique d’un patient consultant pour constipation
  8. Techniques d’exploration du côlon
  9. Exemples d'agents infectieux pathogènes pour le côlon
  10. Bases du traitement de la constipation idiopathique fonctionnelle
Chapitre 5 : Rectum-Canal anal

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  1. Embryologie
  2. Anatomie du rectum et du canal anal
  3. Anatomie de l'appareil sphinctérien
  4. Radioanatomie
  5. Histologie
  6. Physiologie de la défécation
  7. Sémiologie
  8. Examen proctologique
  9. Techniques d’exploration
  10. Bases du traitement
Chapitre 6 : Foie-Voies biliaires

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  1. Embryologie
  2. Anatomie du foie
  3. Anatomie des voies biliaires
  4. Radioanatomie
  5. Histologie
  6. Physiologie
  7. Sémiologie
  8. Examen d’un patient consultant pour ictère
  9. Techniques d’exploration du foie et des voies biliaires
  10. exemple d'agent infectieux pathogène pour le foie : le virus de l'hépatite C (VHC)
  11. Maladies alcooliques du foie
  12. Bases du traitement
Chapitre 7 : Pancréas

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  1. Embryologie
  2. Anatomie
  3. Radioanatomie
  4. Histologie
  5. Physiologie
  6. Sémiologie
  7. Examen clinique d’un patient consultant pour douleur de type pancréatique
  8. Examen clinique d’un patient consultant pour ndouleur épigastrique
  9. Techniques d’exploration du pancréas
  10. Bases du traitement
Chapitre 8 : Péritoine-Paroi abdominale

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  1. Embryologie
  2. Anatomie de l'enceinte abdominale
  3. Anatomie du péritoine
  4. Les enceintes de pression
  5. Radioanatomie
  6. Histologie du péritoine
  7. Sémiologie des péritonites
Chapitre 9 : Histologie digestive

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  1. Structure histologique commune de la paroi digestive : les quatre couches
  2. Particularités histologiques de la paroi digestive en fonction des organes
  3. Principales populations cellulaires épithéliales en function des segments
Chapitre 10 : Motricité digestive

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  1. Support anatomique
  2. Etapes de progression du bol alimentaire
Chapitre 11 : Mouvements d'eau de la bouche à l'anus

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  1. Mouvements d'eau de la bouche à l'anus
Chapitre 12 : Digestion

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  1. Digestion des glucides
  2. Digestion des lipides
  3. Digestion des protéines
Chapitre 13 : Microbiote et immunité intestinale

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  1. Système immunitaire intestinal
  2. Présentation du microbiote intestinal
  3. Fonctions du microbiote intestinal
Chapitre 14 : Oncogénétique digestive

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  1. Place des gènes en oncologie générale
  2. Carcinogenèse colorectale
  3. Maladie génétique à transmission dominante 
  4. Exemples de prédispositions génétiques aux cancers digestifs
  5. Consultation d’oncogénétique, suspicion de prédisposition génétique au cancer
Chapitre 15 : Occlusions intestinales

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  1. Différents types d’occlusion intestinale 
  2. Sémiologie clinique de l’occlusion aiguë
  3. Imagerie de l’occlusion aiguë
Chapitre 16 : Hémorragies digestives

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  1. Sémiologie
  2. Exploration d’une hémorragie digestive 
  3. Points importants de la prise en charge 
  4. Principales causes d’hémorragie digestive
Chapitre 17 : Tromboses du système vasculaire digestif

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  1. Anatomie du système vasculaire digestif abdominal
  2. Physiologie de la circulation splanchnique
  3. Ischémie de l’intestin grêle
  4. Colites ischémiques
  5. Thromboses de la veine porte
  6. Thromboses des veines hépatiques
  7. Imagerie des thromboses du système vasculaire digestif
Chapitre 18 : Diarrhée

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  1. Différents mécanismes de diarrhée, avec leur traduction sémiologique
  2. Explorations fonctionnelles d’une diarrhée
  3. Intrication de fait des mécanismes de diarrhée et implications en clinique
Chapitre 19 : Points clefs en sémiologie digestive

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  1. Examen clinique d’un patient consultant pour douleur abdominale 
  2. Technique de l’examen physique de l’abdomen
Chapitre 20 : Endoscopie digestive

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  1. Vidéoendoscopes
  2. Échoendoscopes
  3. Vidéocapsules endoscopiques
Chapitre 21 : L’essentiel de la radioanatomie digestive en 10 coupes et 5 reconstructions
les fondamentaux de la pathologie digestive