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Thématique :
- Pancréas/Voies biliaires
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Originalité :
Intermédiaire
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| Doit faire évoluer notre pratique : |
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Pas encore
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Nom du veilleur :
Professeur Vinciane REBOURS
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Gut
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2018/12
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2018 Dec;67(12):2131-2141.
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doi: 10.1136/gutjnl-2016-313586.
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Preoperative next-generation sequencing of pancreatic cyst fluid is highly accurate in cyst classification and detection of advanced neoplasia
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Singhi AD, McGrath K, Brand RE, Khalid A, Zeh HJ, Chennat JS, Fasanella KE, Papachristou GI, Slivka A, Bartlett DL, Dasyam AK, Hogg M, Lee KK, Marsh JW, Monaco SE, Ohori NP, Pingpank JF, Tsung A, Zureikat AH, Wald AI, Nikiforova MN
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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28970292
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Abstract
OBJECTIVE:
DNA-based testing of pancreatic cyst fluid (PCF) is a useful adjunct to the evaluation of pancreatic cysts (PCs). Mutations in KRAS/GNAS are highly specific for intraductal papillary mucinous neoplasms (IPMNs) and mucinous cystic neoplasms (MCNs), while TP53/PIK3CA/PTEN alterations are associated with advanced neoplasia. A prospective study was performed to evaluate preoperative PCF DNA testing.
DESIGN:
Over 43-months, 626 PCF specimens from 595 patients were obtained by endoscopic ultrasound (EUS)-fine needle aspiration and assessed by targeted next-generation sequencing (NGS). Molecular results were correlated with EUS findings, ancillary studies and follow-up. A separate cohort of 159 PCF specimens was also evaluated for KRAS/GNAS mutations by Sanger sequencing.
RESULTS:
KRAS/GNAS mutations were identified in 308 (49%) PCs, while alterations in TP53/PIK3CA/PTEN were present in 35 (6%) cases. Based on 102 (17%) patients with surgical follow-up, KRAS/GNAS mutations were detected in 56 (100%) IPMNs and 3 (30%) MCNs, and associated with 89% sensitivity and 100% specificity for a mucinous PC. In comparison, KRAS/GNAS mutations by Sanger sequencing had a 65% sensitivity and 100% specificity. By NGS, the combination of KRAS/GNAS mutations and alterations in TP53/PIK3CA/PTEN had an 89% sensitivity and 100% specificity for advanced neoplasia. Ductal dilatation, a mural nodule and malignant cytopathology had lower sensitivities (42%, 32% and 32%, respectively) and specificities (74%, 94% and 98%, respectively).
CONCLUSIONS:
In contrast to Sanger sequencing, preoperative NGS of PCF for KRAS/GNAS mutations is highly sensitive for IPMNs and specific for mucinous PCs. In addition, the combination of TP53/PIK3CA/PTEN alterations is a useful preoperative marker for advanced neoplasia.
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Quelle est la fréquence des mutations KRAS/GNAS et TP53/PIK3CA/PTEN dans les lésions kystiques pancréatiques mucineuses et invasives ?
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Séquençage NGS fait sur du liquide de LKP extrait par ponction sous échoendoscopie. Au total, 626 liquides étudiés et validation sur une cohorte indépendante chirurgicale (n=159).
Il a été identifié des mutations KRAS/GNAS chez 308 (49%) et TP53/PIK3CA/PTEN chez 35 (6%) dans la cohorte initiale. Dans la cohorte de validation, mutations KRAS/GNAS détectées chez 56 patients (100%) des TIPMP et 3 (30%) des cystadénomes mucineux.
Par NGS, la combinaison de mutations KRAS/GNAS et TP53/PIK3CA/PTEN a une sensibilité de 89% et une spécificité de 100% pour une tumeur avancée.
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La recherche de mutations dans le liquide de ponction pourrait orienter la prise en charge et motiver une résection en cas d’altérations génétiques multiples dont KRAS/GNAS et TP53/PIK3CA/PTEN. En pratique il n’est pas proposé de telles techniques pour le suivi des patients avec LKP qui sont coûteuses et invasives (nécessité de ponction de liquide). L’intérêt serait pour des indications chirurgicales borderlines ou à risque opératoire important pour lesquelles la présence de mutations serait un argument supplémentaire pour proposer la chirurgie. A confirmer.
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